川崎市沖に存在するＧアイランドシティは宇宙開発公団の存在する、全周１２ｋｍの人工島である。
宇宙開発公団とは科学技術庁管轄下の特殊法人である。
だが、Ｇアイランドの地下深くには地上最強の勇者たちが存在する。
宇宙開発公団総帥を務める大河幸太郎が長官を兼任する日本国立地球防衛軍、ガッツィ・ジオイド・ガード通称ＧＧＧがそれである。
ＧＧＧは西暦２００３年に地球に飛来したＥＩ－０１により地球外知性体の侵略から地球を防衛するために設立された。
それに用いられる技術は地球外文明の産物であるギャレオンから与えられた、緑の星の技術であるＧＳライドなど、オーバーテクノロジーを駆使して成り立っている。
さて、先日、新宿にある都庁ビルの眼前で行われたＥＩ－０２との交戦でデビューを果たしたガオガイガーであったが、各ガオーマシンの合体プログラムの不備や、ガオガイガーとフュージョンする勇者・獅子王ガイのサイボーグ体制御機構の不安定化により不眠不休の対応が行われている正にその時に、世界を揺るがす事件は発生したのであった！
ＧＧＧベイタワー基地のエリアⅥ、サイボーグガイ専用の治療室には獅子王ガイが専用メンテナンスベッドに横たわり各身体機能の調整を行っていた。
ベッドからは沢山のコードやチューブ類がガイの体に伸びていた。
彼の横にはウサギの耳のように髪をカラーで立たせた女性が、彼のことを心配しながら見つめていた。
彼女の名は卯都木 命、２年前のＥＩ－０１の地球侵入事件によって天涯孤独の身となり、若干２０歳でＧＧＧの機動部隊担当のオペレーターとして活躍する女性である。
ガイはゆっくりと目を開けると、命に目を向け、弱々しく声を掛けた。
「どうしたんだ、命。今日はずいぶんと静かじゃないか」
「ううん。ごめんねガイ、私のオペレーションがもっと上手だったらこんな事にならなかったのかも知れないのに」
「なにを言うかと思えば。命のせいじゃないさ。 ・・・身体機能の大部分を機械に置き換えたサイボーグ第１号なんだから、いろいろと不具合も出てくるさ。それも親父が対策を取っているし。気にするなよ」
「でも、・・・」
「オイオイ、・・・命がしずんでると、こっちまで沈んできちまう。いつものように明るい命を見せてくれよ」
「・・・ウン！ そうね、ゴメン、ガイ。アハ」
彼女が顔に笑みを浮かべると、ガイも釣られたように笑いを浮かべた。だが、すぐに考え事を始めてしまい心配そうな表情になってしまった。
「どうしたのガイ？ 」
「いや、ＥＩ－０２と戦ったときに現れた緑のハネを持つ少年・・・。彼は一体 ・・・」
「長官は諜報部を使って調査を始めたそうだけど、・・・ 大丈夫かなぁ」
「どうして、何が心配なんだ？ 」
「だって、あの子が私たちの味方だとして、あの位の男の子が突然あの黒服軍団に拉致されたら、いくらなんでも私たちのことを嫌いになったりしないかしら、なんて思ったの」
ガイはその光景を想像してみた。そしてそれは充分にあり得ることだと彼女の説に納得した。
「そうだな ・・・。命の方から長官に進言しといてくれないか？ 俺たち勇者のやることではないってさ」
「うん、そうする。 じゃあ、私はメインオーダールームに行くわ。そろそろスワンがしびれを切らすかも知れないし」
「ああ、じゃあな」
「また来るね、ガイ！ 」
彼女はガイに向かって手を振りながら通路に消えていった。
「ふふ、命は昔から変わらないな。あの時から、」
そう呟くと獅子王ガイの意識は眠りの中に落ちていった。
Ｇアイランドにあるカモメ第１小学校３年生の天海 護は同級生で幼なじみでもある初野 華、同級生の牛山 末男、数納 鷹泰、狐森レイコの５人で下校していた。
「ねぇマモルくん」
「なに、ハナちゃん」
「あのね、この前の時（ＥＩ－０２迎撃戦）、急にいなくなってたけど、どこに行ってたの？ 」
「え、えっと・・・」
護はそれを聞いて動揺を隠せなかった。
まさか、緑の羽根を生やして、謎の生機融合体を浄解していただのと言えるわけがないからだ。
まさか、自分にそんな能力があるなどと夢にも思ってなかったし、今でも信じられない。
＜でも、あの時はそうしなきゃならない気がしたんだ。＞
護が口ごもっていると牛山末男ことウッシーがからかい半分で言った。
「マモルゥ。トイレにでも行ってたんじゃないのか～？ エンガチョ～！」
「ちっ、違うよー！ 」
「ホントかぁ？ 」
「ほんとだってばぁ」
「それにしてもあのロボットって凄かったよねー」
今度は自慢げな顔をした男の子、数納 鷹泰が護に言った。
「あの胸にライオンが付いたロボットの事？」
「そう、ボクはバッチリビデオに撮ったけどね」 フフン
「なあにアンタ、いつもそんなの持ち歩いてんの？ ビンボくさ～いって感じ」
如何にも金持ちです、と自慢げな数納少年に狐森レイコがお嬢様モードで突っ込みを入れた。
すると、あっさりと数納少年は涙を流してしまった。
しかし、狐森レイコはそんな数納を無視するかのように空想モードに突入した。
「ああ～、それにしてもまたあのチョベリカチョロンさまに会えないかしら」
「チョベリカチョロン？」
「ほら、あの金色の超ベリーカッチョイイロンゲ様のことよ、ああ～、チョベリカチョロンさまー」
「あはは」
「俺、あのロボットのこと知ってるぜ！ 俺の兄ちゃんが働いてるスリージーのスーパーロボット、ガオガイガーってんだぜ」
「ガオガイガー？」
「ああ、俺の兄ちゃんが整備してんだぜ。ウチの兄ちゃんってスゲエだろ！」
「ウワッハー！ ウッシーの兄ちゃんてスゴイや。ね、すごいねハナちゃん」
「え、う、うん、そうねマモルくん」
何がどう凄いのか良く分からなかった華は戸惑ったように愛想笑いを浮かべた。
５人はそうやってはしゃぎながら下校していたのだが、途中の海べりの道まで来たとき不意に護は立ち止まった。
海辺から見える景色に護は妙な違和感を感じていた。
なんだろう、またあのゾンダーがあらわれたのかな？
護がそうして対岸の方をボーっと見ているとウッシーが大きな声で呼びかけた。
「どうしたー！ マモルーっ！ 先行っちゃうぞー」
「すぐ行くーっ！」
少し離れてしまった友達に追いつこうと駆け出した瞬間、足がもつれた。
Ｇアイランドが、いや、世界全体が大きく揺れたのである。
護が海の方を見ていた頃、ＧＧＧ本部のエリアⅥ、３式空中研究所内にある研究施設の一角を陣取っている空間湾曲率測定器から、異常なデーターが検出され始めていた。
獅子王麗雄博士率いる研究者集団は、それらのデーターの解析を始めた。
異常を知らせる警報は宇宙開発公団総帥を務める大河幸太郎にも届いていた。
彼は机の一角に＜非常事態＞の知らせを認めると、室内にいた秘書の桜（妙齢の美女）に声を掛けた。
「あ～、桜くん。済まないが珈琲を煎れてきてはくれないかね。ブラックで、」
書類の整理をしていた桜さんは大輪の薔薇のような笑みを浮かべて頷いた。
「かしこまりました、大河総裁。少々お待ち下さい」
「ああ、君の煎れてくれた珈琲は格別だからね」
「まぁ。それは腕を振るい甲斐がありますわ」
大河総裁は嫌味を感じさせない笑いを浮かべて、桜を送り出した。
「さて、」
大河総裁は机の引き出しの奥に隠されているボタンを押し込んだ。
それと同時に椅子周辺の床が沈み込み、大河長官ごと地下のＧＧＧ本部へと直滑降していった。
数分後。
「総裁。お待たせいたしました。 あら？ 」
また、大河総裁がいなくなっていた。ここ最近、こんな事が多い。
まぁ、忙しい人だから仕方がありませんわ。
ＧＧＧの司令塔、メインオーダールームにＧＧＧ長官大河幸太郎が降りてきた。
いつの間にかアルマーニのスーツから妖しさ爆発だいのＧＧＧ長官服に着替えて、エレベーターから姿を現した。
メインオーダールームのメインオペーレーターの全員がコンソールに向かって、鬼気迫る勢いで仕事をこなしていた。
「お早うございます、長官！」
大河長官に気付いた卯都木 命オペーレーターが挨拶をし、それで長官の到着を知ったオペーレーター達全員が、長官に向かって挨拶を行った。
「おはよう諸君。獅子王博士、一体何が起こったのですか？ 」
大河長官はすぐ目の前の席に座っている老齢のはげ上がった男、ＧＧＧの統括開発責任者を任じる獅子王麗雄博士に訊いた。
「おお、長官。それがボクにもよく分からんのだよ、ただ、世界的な規模で空間の揺らぎが発生している。下手をすると今日が地球最後の日となるのかも知れん」
「ええ！ それは・・・」
さすがの大河長官も動揺を隠しきれなかった。だが、そこで怯まないのが勇者の勇者たる由縁である。
「博士、それは地球外知性体の侵略行動と考えて良いのですか？ 」
「ふぅ～む。いや、それは考えられんでしょう。例のギャレオンから受け取った情報からすると、彼らの目的は地球人類そのものに対する＜福祉＞な訳ですからな。こちらにとってはとことん迷惑な話だが、」
「だが、手をこまねいている訳にもいかん。牛山君、ガオガイガーの整備状態はどうかね？ 」
長官の呼びかけに振り返った男、彼は牛山家の長男で牛山一男、２２歳牡牛座。
植物栽培が生き甲斐の、優しそうな瞳をした大男だ。
「はい、ステルスガオー、ライナーガオー、ドリルガオーらのガオーマシンの整備は完全に行われています！」
「うむ、ガイの調子はどうですか？ 博士」
「それが・・・」
「俺なら、この通りいつでも出撃 ＯＫです長官！」
「ガイ・・」
「ガイ！」
声がした方に振り向いてみると、金色のアルティメットアーマーを着けた獅子王ガイが扉に身を預けて立っていた。
だがしかし、その様子はかなり辛いように見受けられる。
「いけるのだな、勇者よ」
「もちろんです。こんなことで挫けていたらサイボーグになった甲斐がないという物です。」
「ガイ！ 無茶しないで、貴方の体はまだ完全じゃないのよ」
「心配するな、俺はサイボーグだ！ 」
「・・・・・・だから心配なんじゃない・・・・・・」
「よし、それでこそ勇者だ！ ＧＧＧ機動部隊！ 首都圏防衛任務に、出動せよ！」
「「「了解！」」」
ガイは身を翻すと扉の向こうへ姿を消した。
「３段飛行甲板空母発進準備！」
「了解！ 各ガオーマシンの発進準備を急げ！」
「関係各省庁への連絡を急げ、総理大臣への直通回線を開いてくれたまえ」
メインオーダールームの喧噪はますます増して行くばかりであった。
「３段飛行甲板空母発進します」
「よし、承認」
メインオーダールームの存在するヘキサゴンから３段飛行甲板空母が切り離され、地下水路を進んでいった。
地面が大きく揺れて、護は足をもつれさせてしまった。
「あいたー！ でっかい地震だなぁ」
「マモルくん大丈夫だった？」
「うん、だいじょうぶだよハナちゃん」
「しっかりしろよなマモル」
「へへ。え？」
「どうしたんだマモル？」
護は対岸の川崎地区の上空に、歪みが出来ているのを見ていた。
「あれ、何かな？」
「蜃気楼じゃない？ ボク、初めて見るよ」
「アンタ莫迦ねぇ、東京湾に蜃気楼なんか出る訳ないじゃないの」
「うるるーっ」
その時、護が声を上げた。
「見て！」
「え？」
全員が護の指差す方向に注目した。
すると、歪みの中から３つの巨大な人型が現れた。
それらは凶暴な鬼のような雰囲気を持っていた。
ひとつ目は一つ眼の「青鬼」のようであり、ふたつ目は巨大なひとつ角を持つ紫色の「鬼」、みっつ目は四つの眼を持つ「赤鬼」であった。